九三學社曲靖市地方組織始建于1986年，初期稱九三學社曲靖市支社籌備組。1987年12月16日成立九三學社曲靖市支社,主任委員韓統勛，時有社員17人。1989年1月召開全體社員大會換屆選舉，主任委員呂富韜，時有社員49人。1991年12月第一屆基層委員會成立,時有社員51人。1995年3月，成立九三學社曲靖市委員會籌備組，時有社員64人。

2000年4月召開全體社員大會,九三學社曲靖市第一屆委員會成立,主任委員陳吉書，時有社員98人。2005年9月召開社員代表大會，選舉產生九三學社曲靖市第二屆委員會，時有社員145人。2010年9月召開社員代表大會，選舉產生九三學社曲靖市第三屆委員會,時有社員183人。2017年5月召開社員代表大會，選舉產生九三學社曲靖市第四屆委員會，主任委員周智鷗，時有社員252人。

社員由建立組織初期的17人發展到2021年6月底281人。其中，高級職稱168人，占比59.8%；中級職稱91人，占比32.4%。博士、碩士40人，占比14.2%；省市級人大代表、省市級政協委員25人，占比8.9%。社市委設8個基層支社，10個工作委員會。